NGS: высокопроизводительное секвенирование - Ребриков Д.В.

В книге "NGS: высокопроизводительное секвенирование" рассмотрены различные варианты и особенности современных методов определения структуры нуклеиновых кислот (методов секвенирования второго и третьего поколений). Описаны принципы наиболее популярных технологий высокопроизводительного секвенирования (NGS). Дана классификация высокопроизводительных методов секвенирования по нескольким параметрам.

Приведены основные элементы первичного анализа данных масштабного секвенирования. Отдельные главы посвящены применению NGS для решения различных биологических задач: секвенирования прокариотических и эукариотических геномов и транскриптомов, метагеномного секвенирования, а также использованию NGS в медицинской практике.

Для сотрудников генно-инженерных и медицинских диагностических лабораторий, а также для преподавателей и студентов, специализирующихся в области молекулярной биологии и биотехнологии.

Нельзя не заметить, что методы молекулярной биологии со временем становятся все сложнее и дороже, и, вместе с тем, теряют в разнообразии. Многие задачи на этапе планирования эксперимента сводятся к типовым методическим шагам, выполняемым по принципу «заказа услуг на стороне». Уход сложных и дорогостоящих методов в сервисные центры, наряду с очевидными преимуществами такой специализации, имеет и ряд негативных последствий. Поверхностное знание методов исследования, провал между биологическим материалом и данными в компьютере приводят к непониманию границы возможностей используемых методик.

Стремительное развитие методов секвенирования в последние годы привело к ощущению, что с их помощью можно решить любые задачи генетики. Тем не менее высокопроизводительное секвенирование, как и любой другой метод, имеет ряд ограничений. Так, вопреки распространенному мнению, NGS не является панацеей при исследовании мультифактор- ных заболеваний и лишь помогает чуть быстрее выполнить определенные методические шаги.

Данная книга пытается сдержать растущий провал между объектом и анализируемыми данными, подробно и с практическими рекомендациями, перечисляя все этапы технологии NGS.